据考古学家的研究，古代玛雅金字塔主要用作宗教仪式和祭祀中心，而不是像埃及金字塔那样作为陵墓。这些金字塔内部通常包含有神殿、祭祀室或者阶梯通向顶部的平台。

在一些玛雅金字塔中，考古学家发现了以下内容：

1. 祭祀室：金字塔内部有时会有小房间或地下室，用于举行祭祀仪式。这些房间里可能有祭坛、雕像或其他宗教物品。

2. 玛雅文物：包括陶器、珠宝、石雕、壁画等，它们提供了关于玛雅文化、艺术和历史的重要信息。

3. 遗骸：在一些金字塔中发现了人类遗骸，可能是玛雅贵族或祭司，他们可能在仪式中被献祭。

4. 文字记录：玛雅人使用象形文字系统，有些金字塔内有刻有文字的石板或壁画，揭示了他们的历史、神话和历法知识。

5. 天文观测设备：一些金字塔的设计与天文事件相关，比如日出、日落或星体的位置，这表明玛雅人在天文学上的高超知识。

然而，对于许多玛雅金字塔，我们仍然不清楚其全部的秘密，因为许多结构尚未被完全发掘或研究。由于这些遗址的复杂性和敏感性，考古学家通常会谨慎地进行发掘工作，以保护这些宝贵的文化遗产。